Sejarah STIMATA diawali dari Akademik Akademik Manajemen Informatika dan Komputer (AMIK) Pusat Pendidikan Komputer Indonesia Amerika (PPKIA) Malang yang telah berdiri sejak tahun 1996. Pada saat itu AMIK PPKIA Malang menelenggarakan Program D3 Manajemen Informatika.

Kemudian pada tahun 2000, AMIK PPKIA Malang yang dikelola Yayasan Bina Citra Muda Malang, berubah statusnya menjadi Sekolah Tinggi dan dikelola oleh Yayasan Pradnya Paramitha. Sekolah tinggi tersebut bernama Sekolah Tinggi Manajemen Informatika dan Komputer (STMIK) Pradnya Paramita.

STMIK Pradnya Paramita resmi beroperasi melalui SK Mendiknas RI nomor : 114D/O/2000 tanggal 26 Juli 2000, tentang pendirian STMIK Pradnya Paramita dan pengitegrasian Akademi Manajemen Informatika dan Komputer (AMIK) PPKIA ke dalam STMIK Pradnya ParamitaMulai Tahun 2000, STMIK Pradnya Paramita yang di singkat STIMATA menyelenggarakan D3 Manajemen Informatika, S1 Sistem Informatika dan S1 Teknik Informatika.